Dados do Trabalho

Título

Abordagens de sequenciamento de longo/curto alcance para estudar a suscetibilidade a doenças em híbridos e espécies de Callithrix por imunogenética, virômica, e metagênomica

Resumo

Saguis urbanos são potenciais reservatórios virais de arbovírus e outros vírus que surgiram recentemente no sudeste do Brasil. As introduções de animais híbridos de espécies exóticas e arboviroses, respectivamente, representam mudanças antropogênicas custosas. Como a composição misturada de genes imunes afeta a suscetibilidade híbrida à doença patogênica? Começamos a investigar esta questão em saguis selvagens (Callithrix) no sudeste do Brasil, onde espécies de saguis introduzidos hibridizam entre si e saguis nativos. Além disso, estamos estudando a variabilidade imunogenética de saguis em cativeiro no Brasil e na Alemanha. Assim, estamos investigando a suscetibilidade as doenças infeciosas em saguis híbridos e não híbridos, integrando dados genômicos do complexo Major Histocompatibility Class I (MHC), bem como outros genes imunológicos e perfis de viroma e microbioma do hospedeiro. Aqui discutimos os aspectos técnicos do uso do sequenciamento de leitura longa da Oxford Nanopore para sequenciar regiões genômicas complexas. Também discutimos os aspectos técnicos do uso do sequenciamento de leitura curta da Illumina para estudar o viroma e o microbioma em conjuntos de dados de Callithrix de RNAseq e DNAseq originários de sangue e swab de bochecha do hospedeiro. Apresentamos dados preliminares sobre porções reconstruídas de segmentos Caja B/C e G/F do MHC I de várias espécies e híbridos de Callithrix. Também relatamos a análise metagenômica preliminar de componentes virais e bacterianos das respectivas bibliotecas construídas a partir de vários Callithrix híbridos e não híbridos. Para o componente viral dos nossos dados do RNAseq, encontramos uma alta abundância de fagos bacterianos da ordem viral Caudovirales. Para o componente viral de nossos dados de DNAseq, encontramos uma alta abundância de anelovírus, papilomavírus e bacteriófagos. Este estudo aproveita o potencial de estudos imunogenéticos e patogênicos de primatas platirrinos para revigorar uma mudança de paradigma nos estudos da diversidade e de saúde animal.

Financiadores

Este trabalho foi financiado por uma bolsa brasileira de pós-doutorado CNPq Jovens Talentos (302044/2014-0), uma bolsa brasileira CNPq DCR (300264/2018-6), uma bolsa de conservação da American Society of Primatologists Conservation Small Grant, uma bolsa individual Marie-Curie (AMD -793641-4) e uma bolsa de pesquisa da International Primatological Society para JM. Este trabalho também foi apoiado por uma bolsa de investimento em pesquisa SOLS/OKED da Arizona State University para RAC, AV, MAW e JM, bem como uma bolsa de pós-doutorado RTI da Arizona State University para JM. Financiamento interno adicional do Centro Alemão de Primatas para LW e JM também apoiou este trabalho.

Palavras-chave

sagui, híbrido, virus

Área

Área 5 – Genética