Dados do Trabalho

Título:

VIROMA FECAL DE PREGUIÇA-DE-COLEIRA (BRADYPUS TORQUATUS) DE UM FRAGMENTO DE MATA ATLANTICA DO RIO DE JANEIRO

Resumo:

A preguiça-de-coleira (Bradypus torquatus), categorizada como vulnerável pela IUCN (International Union for Conservation of Nature's), é uma espécie endêmica da Mata Atlântica do Brasil, registrada nos estados de Sergipe, Bahia, Espírito Santo, Rio de Janeiro e Minas Gerais. Preguiças são reservatórios conhecidos de alguns arbovírus, entretanto, o conhecimento acerca da diversidade viral infectando naturalmente tais animais ainda é escasso, o que reforça a importância de expandir o conhecimento relacionado a esse tema. Viroma é o nome dado ao conjunto de todos os vírus encontrados em determinada amostra biológica e pode ser explorado por tecnologias de sequenciamento massivo (High Throughput Sequencing – HTS). Este trabalho descreve pela primeira vez a diversidade viral de 7 indivíduos de B. torquatus de fragmentos da mata atlântica do município de Silva Jardim - RJ. As amostras fecais coletadas foram enviadas ao Laboratório de Diversidade de Doenças Virais (LDDV) da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) para processamento e análise. As amostras foram reunidas em um único pool e submetidas às etapas clássicas conhecidas na literatura para análise de Viroma (D’arc et al, 2020), como enriquecimento viral, extração de ácidos nucleicos virais, síntese de cDNA e confecção da biblioteca. O sequenciamento massivo foi realizado na plataforma Illumina Miseq do Departamento de Genética/UFRJ. A análise dos dados foi conduzida a partir de uma pipeline interna, com etapas de filtragem (Fastp v.0.20.1), montagem de novo (Meta-spades v.3.15.3), atribuição taxonômica (Diamond v.2.0.14) e visualização dos dados (Krona v.2.7.1). Obtivemos um total de 3.442.240 leituras brutas. Após filtragem por qualidade (Q30) e tamanho (> 50 pb), recuperamos um total de 1.890.772 reads (55%) das quais 98.694 foram anotadas, sendo 294 delas (0,3%) taxonomicamente associadas a vírus. Corroborando com os dados da literatura para outros animais, a grande maioria dos resultados obtidos são de bacteriófagos (164 reads, 55% das sequências virais). Além desses, encontramos vírus de vertebrados (59 reads, 21%) e outros vírus relacionados a plantas, invertebrados, fitoplânctons e protozoários (66 reads, 23%). Dentre as famílias virais de vertebrados encontradas se destacaram Circoviridae, Papillomaviridae, Parvoviridae e Retroviridae. As famílias virais identificadas pelo presente estudo foram os primeiros registros conhecidos por abordagem metagenômica nesse hospedeiro. Apesar dos achados, análises mais robustas são necessárias para explorar devidamente a diversidade viral entérica de B. torquatus e relacionar com a saúde desses animais, auxiliando em sua conservação, além de determinar a origem e evolução dos vírus circulantes nessa população.
Palavras-chave: Metagenômica, Sequenciamento massivo, Diversidade viral, Pilosa, Xenarthra, Preguiça-de-coleira, Bradypodidae.

Financiamento:

Área

Parasitologia/Epidemiologia